O Vivaldi, por si só, não cria mensagens, à partida essas mensagens vêm da conta.
O que pode estar a acontecer, por exemplo, é as mensagens serem automaticamente marcadas como SPAM no servidor (normalmente são enviadas para uma pasta spam ou algo do género); e no Vivaldi estar numa vista em que vê todas as mensagens, incluindo as de spam.
Por exemplo, eu costumo usar a vista "Todas as mensagens" -> "Por ler" e nunca vejo as mensagens que são marcadas como SPAM pela minha conta do GMail (mas vejo outras que não foram ainda marcadas como spam, apesar de o serem, só que não foram reconhecidas pelos algoritmos como tal).
Sugiro dar uma vista de olhos aos filtros ativos na lista de mensagens (ícones ou botões - dependendo da configuração) e confirmar que as mensagens de SPAM não estão visíveis. https://help.vivaldi.com/pt-pt/mail-pt-pt/mail-get-started-pt-pt/ver-e-gerir-mensagens/#Filtrar_mensagens
Agora que releio a mensagem, fiquei na dúvida sobre o tipo de mensagens a que se refere. Se se trata de mensagens geradas de cada vez que o Vivaldi acede ao servidor (e que eu não chamaria de SPAM, talvez alertas de segurança?), então aí é uma questão de ver junto do responsável do servidor de correio eletrónico, qual a forma de aceder ao serviço com um cliente externo sem estar sempre a gerar esses alertas. Uma forma pode ser através de dupla autenticação, por exemplo, ou (des)ativando alguma opção nas definições do servidor...
Ainda assim, eu diria que nesse caso essas mensagens deveriam ocorrer mesmo quando acede com outros clientes de correio eletrónico (usando o mesmo método).