Eu tenho um par de websites com esse tipo de autenticação (em que aparece uma janela de diálogo para se meter a autenticação) e as palavras-passe estão guardadas no Vivaldi e normalmente são preenchidas (nem sempre - às vezes tenho que recarregar a página para isso acontecer). Mas posso garantir que funciona.
De qualquer forma, sem saber qual é o website, é difícil saber qual pode ser o problema em concreto e dar dicas úteis...
